Az endometriózis kialakulásának pontos oka nem ismert. A genetikai háttér mellett három másik tényezőt is azonosítottak, amelyeknek szerepe lehet az endometriózis kialakulásában:
- Az immunrendszer nem megfelelő válasza
- Túlzott mennyiségű ösztrogén a szervezetben
- Gyulladás